基础科研发表1-3分文章套路(二)

2018.11.20 14:03
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  做基础科研时,发表文章是展示成果的途径。那怎样快速发表SCI文章呢,下面小编将从4个方面为大家来说说发表套路,这次的文章的内容主要围绕高通量组学出发的研究。

  基于高通量组学出发的研究

  一、套路

  样本收集、芯片、测序等其他高通量技术检测、简单验证

  二、文章案例解读

文章案例.png

文章思路.png

文章结果展示总结.png

  三、数据库操作演示

  GEPIA:http://gepia.cancer-pku.cn/

GEPIA数据库操作.png

GEPIA数据库操作.png

GEPIA数据库操作.png

GEPIA数据库操作.png


  四、实例展示如何分析和作图

  组学数据的常见几个图:1. 火山图

  使用工具:Graphpad Prism

  数据:Volcano Plot.xls(链接: https://pan.baidu.com/s/1i5zLfHN 密码: 4fb1)


火山图数据图展示.png

火山图数据图展示.png

  五、从结果到成文

  写作提纲

  Overview of Gene expression profiles

  DEGs identification

  Hierarchical clustering/PCA analysis of DEGs

  Gene Function Annotation (GO and Pathway analysis)

  Network Construction (based on Interaction, Co-expression , Target Prediction. etc)

  Hub-Gene expression validation (with qPCR, WB, IHC , ELISA or GEO/TCGA database)

  Clinical Significance of Hub-gene as diagnostic or prognostic biomarker

  Novel Gene Functional Research in vivo or in vitro

  Up stream or down stream mechanism of Novel Gene in Disease

一篇标准的芯片、测试文章.png

结果描述原则.png

结果描述原则.png

  六、杂志选择和投稿

杂志选择和投稿.png

  七、关键问题和注意事项

  (一)套路的注意事项

  (1)对技术依赖性高:数据结果基本来源于公司,流程的单一性与课题的个性某种程度上矛盾;

  (2)高通量检测的技术创新性正在减弱,套路易学,普通工具;

  (3)抢新、抢时间:前2-3篇尚可,以后筛选+验证这一策略会越来越困难;

  (4)对于科研思维的锻炼有限;

  (二)如何让组学数据的文章分数更高?

  1.多个数据联合分析,比如GEO、TCGA和自己的实验结果;

  2.常规分析+个性化分析,图要漂亮;

  3.选取角度深入,OT的文章一般多个分子的Panel,比如某一家族、某条通路等;

  4.重点选出一个新分子展开后续研究;

  关于基础科研发表1-3分文章套路(二)的讲述就到这里了,上述的内容只是截取了资料中的一部分,如需获取完整的资料,可通过关注微信公众号后联系客服获取。

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